|
УВАЖАЕМЫЕ СОТРУДНИКИ,
просим вас указывать в публикациях, выполненных с использованием оборудования ЦКП или ресурсных коллекций ИБР РАН, что «Работа проводилась с использованием оборудования (ресурсных коллекций) ЦКП ИБР им Н.К. Кольцова РАН, в рамках выполнения ГЗ ИБР РАН № 0088-2021-ХХХХ» – для русскоязычных публикаций и для англоязычных публикаций: «The research was done using the equipment of the Core Centrum of the Institute of Developmental Biology RAS. The work was conducted in the frame of IDB RAS RP № 0088-2021-XXXX».
Общие сведения
- Центр коллективного пользования (ЦКП) работает на условиях, определяемых Положением о Центре;
- Научным руководителем ЦКП является директор ИБР РАН;
- Непосредственное руководство ЦКП осуществляет руководитель ЦКП, назначаемый Приказом по Институту;
- С 04.06.2019 г. руководителем ЦКП, согласно Приказу № 116/зп, является д.б.н. Воронежская Елена Евгеньевна
Сотрудники:
Блохин Виктор Евгеньевич – к.б.н., н.с.
Алпеева Елена Викторовна – к.б.н., с.н.с.
Иноземцев Владимир Александрович – к.б.н., н.с.
Центр коллективного пользования по биологии развития на основе использования клеточных технологий и оптических методов исследования
при Федеральном государственном бюджетном учреждении науки Институте биологии развития им. Н.К. Кольцова РАН
(ЦКП ИБР РАН)
Цель деятельности:
- ЦКП ИБР РАН - обеспечение российских научных коллективов современной исследовательской инфраструктурой для проведения фундаментальных и прикладных исследований на основе интеграции высокоразрешающих методов микроскопии, экспериментальной биологии развития, клеточных технологий, молекулярно-генетических и биоинформатических методов; развитие и внедрение инновационных подходов для изучения биологических объектов на различных уровнях организации.;
Задачи ЦКП ИБР РАН:
- Создание инфраструктуры мирового уровня для проведения фундаментальных и прикладных исследований в области биологии развития, клеточной и регенеративной биологии и биомедицины.
- Развитие новых методических подходов и внедрение инновационных технологий, обеспечивающих повышение эффективности научных исследований и прикладных разработок.
- Устранение дефицита в инфраструктуре для научных исследований, в части доступа к методам электронной микроскопии, экспериментальной эмбриологии и клеточных технологий.
- Развитие и расширение взаимодействия научных коллективов; обеспечение междисциплинарности фундаментальных и прикладных исследований; интеграция институтов РАН, медицинских, образовательных и коммерческих организаций для решения фундаментальных и прикладных задач. Накопление методического опыта в ходе реализации на базе ЦКП междисциплинарных проектов.
- Материально-техническая поддержка исследований в рамках традиционных российских научных школ, позволяющая вывести их научные проекты на мировой технологический уровень при сохранении уникальных научных подходов и многолетнего опыта.
- Привлечение высококвалифицированных научных кадров к разработке и внедрению новых методов исследований на базе ЦКП.
- Подготовка кадров высшей квалификации, проведение научных стажировок, школ для молодых исследователей, участие студентов и аспирантов в выполнении фундаментальных и прикладных научных исследований.
- Расширение спектра услуг ЦКП, в том числе для внешних пользователей; повышение эффективности использования уникального дорогостоящего оборудования; консолидация возможностей подразделений ИБР РАН для поддержания работоспособности оборудования ЦКП.
- Использование материально-технической базы и квалифицированного персонала ЦКП для повышение публикационной эффективности организации, получения патентоспособных продуктов, поддержания технологического лидерства и эффективной коммерциализации результатов интеллектуальной деятельности.
Перечень услуг ЦКП ИБР РАН:
1. Высокоразрешающая световая, флуоресцентная и лазерная конфокальная микроскопия
- подготовка биологических образцов для световой, флуоресцентной и лазерной конфокальной микроскопии;
- иммуногистохимическое и иммунофлуоресцентное маркирование клеток, тканей и эмбрионов;
- мультиплексная флуоресцентная гибридизация in situ (HCR-FISH/ISH-HCR) для пространственного анализа экспрессии генов;
- получение многоканальных изображений биологических объектов с использованием флуоресцентной и конфокальной микроскопии;
- трехмерная реконструкция тканей и органов, морфометрический и количественный анализ микроскопических изображений;
- совместный анализ данных мультиплексной гибридизации in situ, иммуногистохимического маркирования и конфокальной микроскопии;
- компьютерная обработка больших массивов микроскопических изображений, трехмерная визуализация и количественный анализ с использованием вычислительного кластера.
2. Лазерная микродиссекция и пространственный молекулярный анализ
- выделение отдельных клеток, клеточных популяций и участков тканей методом лазерной микродиссекции;
- подготовка образцов для последующего молекулярно-генетического анализа;
- пространственная регистрация и сопоставление результатов лазерной микродиссекции с данными микроскопии и молекулярного анализа;
- методическое сопровождение исследований с использованием технологии лазерной микродиссекции.
3. Молекулярно-генетические технологии
- выделение ДНК и РНК из клеток, тканей и других биологических образцов;
- проведение полимеразной цепной реакции в режиме реального времени (qPCR);
- секвенирование ДНК и фрагментный анализ;
- обработка результатов высокопроизводительного секвенирования;
- биоинформатический анализ данных геномных, транскриптомных и эпигеномных исследований с использованием вычислительного кластера.
4. Клеточные технологии
- культивирование клеток животных и человека;
- подготовка и поддержание клеточных культур, паспортизация клеточных линий, в том числе клеток с индуцированной плюрипотентностью (ИПСК);
- получение и поддержание генетически модифицированных клеточных линий, в том числе иммортализованных, ИПСК
- разработка, получение и наработка плазмидных, вирусных и векторных конструкций;
- получение линий клеток-продуцентов вирусных и векторных конструкций;
- количественный анализ клеточных фенотипов и интеграция результатов клеточных, микроскопических и молекулярно-генетических исследований.
5. Классическая и экспериментальная эмбриология
- криоконсервация и биобанкирование эмбрионов и половых клеток линий лабораторных, а также редких и исчезающих видов животных;
- морфометрический анализ эмбрионального развития;
- оплодотворение in vitro;
- методическое сопровождение исследований в области классической и экспериментальной эмбриологии.
6. Исследования на лабораторных животных
- проведение поведенческих исследований с использованием автоматизированного аппаратно-программного комплекса;
- содержание и обеспечение доступа к SPF-животным;
- обеспечение доступа к специализированным генетически модифицированным, трансгенным и иммунодефицитным линиям лабораторных животных;
- компьютерная обработка и анализ результатов поведенческих исследований с использованием специализированного программного обеспечения и вычислительного кластера.
7. Биоинформатический и вычислительный анализ больших баз данных
- обработка больших массивов данных микроскопии, молекулярной биологии и секвенирования;
- трехмерная реконструкция биологических объектов;
- количественная морфометрия;
- биоинформатический анализ данных геномики, транскриптомики и эпигеномики;
- интеграция результатов, полученных различными экспериментальными методами;
- хранение, обработка и вычислительное сопровождение научных проектов с использованием вычислительного кластера.
8. Биоресурсные коллекции
- предоставление доступа к биоресурсной коллекции паспортизированных клеточных культур ИБР РАН;
- предоставление доступа к биоресурсной коллекции тканей диких животных для генетических исследований;
- предоставление доступа к биоресурсной коллекции природных, лабораторных и хозяйственно значимых линий насекомых для фундаментальных и прикладных генетических исследований.
9. Образовательная и методическая деятельность
- обучение работе на флуоресцентных и лазерных конфокальных микроскопах;
- обучение работе с системой лазерной микродиссекции;
- консультирование по выбору методов исследования, подготовке биологических образцов, проведению экспериментов, анализ, обсуждение и помощь в интерпретации полученных данных.
- консультативное сопровождение при работе на высокотехнологических приборах ЦКП
Документы
Оборудование ЦКП ИБР РАН
МИКРОСКОПИЯ: КОНФОКАЛЬНЫЕ МИКРОСКОПЫ
МИКРОСКОПИЯ: ФЛУОРЕСЦЕНТНАЯ И СВЕТОВАЯ МИКРОСКОПИЯ
ПРОБОПОДГОТОВКА ДЛЯ ГЕНЕТИЧЕСКИХ И ГИСТОЛОГИЧЕСКИХ ИССЛЕДОВАНИЙ
ОБОРУДОВАНИЕ ДЛЯ ПЦР И ГЕНЕТИЧЕСКОГО АНАЛИЗА
ПРОТОЧНАЯ ЦИТОМЕТРИЯ
СИСТЕМЫ ДЛЯ ДОСТАВКИ ВЕКТОРОВ: ЭЛЕКТРОПОРАТОРЫ
СИСТЕМЫ ДЛЯ ДОСТАВКИ ВЕКТОРОВ: ИНЪЕКТОРЫ
СИСТЕМЫ РЕГИСТРАЦИИ ПОВЕДЕНИЯ ЖИВОТНЫХ
|
Федеральное государственное бюджетное учреждение науки
