Комментарий к статье: Genomic signatures of recombination in a natural population of the bdelloid rotifer Adineta vaga O. A. Vakhrusheva, E.A. Mnatsakanova, Y. R. Galimov, T. V. Neretina, E.S. Gerasimov, S. A. Naumenko, S.G. Ozerova, A. O. Zalevsky, I.A. Yushenova, F. Rodriguez, I. R. Arkhipova, A.A. Penin, M. D. Logacheva, G. A. Bazykin, A.S. Kondrashov Nature Communications volume 11, Article number: 6421 (2020)
© Галимов Ян Рудольфович, руководитель лаборатории ЭВОЛЮЦИИ ГЕНОМА И МЕХАНИЗМОВ ВИДООБРАЗОВАНИЯ, кандидат биологических наук.

Подавляющее большинство эукариот размножается половым путем. Переход к бесполому размножению обычно не находится под запретом. Размножение без участия самцов широко распространено среди беспозвоночных, примеры партеногенеза известны также и у ящериц, акул, птиц. На коротких эволюционных дистанциях утрата полового размножения дает организмам значительные преимущества. У самок отпадает необходимость в поиске партнера и, главное, в расходовании ресурсов на производство сыновей, поэтому при прочих равных бесполые организмы размножаются вдвое быстрее. Считается, однако, что в долговременном масштабе отсутствие генетического обмена заводит партеногенетическую линию в «эволюционный тупик», связанный с накоплением вредных мутаций (храповик Меллера) или недостаточной скоростью адаптации (гипотеза Черной королевы). Действительно, большинство партеногенетических популяций и видов очень молоды и имеют близких родственников, которые постоянно или хоть изредка прибегают к половому размножению.

Однако существует несколько крупных таксонов, эволюционная история которых насчитывает сотни тысяч или миллионы лет без полового размножения. Среди членистоногих, к таким таксонам относятся ракообразные - остракоды семейства дарвинулид, панцирные клещи и, насекомые - палочники. Классическим примером древней бесполости считаются бделлоидные коловратки. Эта группа микроскопических животных насчитывает несколько сотен видов, встречающихся в каплях воды на листьях мха, в почве и в водоемах по всему миру. Возраст группы составляет десятки миллионов лет, и за более чем столетие наблюдений и исследований ни у одного их видов Bdelloidea ни разу не удалось обнаружить самца.



Рис. 1. Бделлоидная коловратка Adineta vaga (масштаб – 100 мкм)

Такой «эволюционный скандал» давно привлек внимание как специалистов по коловраткам, так и эволюционных биологов. В последнее время было сделано несколько попыток примирить наши теоретические представления о преимуществе полового размножения с фактом существования этой древней бесполой группы. Несколько высокотехнологичных недавних исследований, казалось бы, подтвердили отсутствие у бделлоидных коловраток половых хромосом и наличие массового горизонтального переноса генов, который мог бы отчасти компенсировать утрату полового размножения. Вскоре, однако, результаты этих исследований были поставлены под сомнение.

Работа Вахрушевой и соавторов, видимо, ставит точку в вопросе наличия или отсутствия у бделлоидных коловраток полового размножения. Анализ 11 полных геномов бделлоидных коловраток Adineta vaga, взятых из природных популяций в Подмосковье и Костромской области показал ряд особенностей, несовместимых со строго клональным размножением и отсутствием генетического обмена.

При клональном размножении можно ожидать что, соотношение гомозигот и гетерозигот по полиморфным локусам будет значительно отличаться от ожидаемого согласно закону Харди-Вайнбергу, однако частоты соответствующих генотипов A. vaga оказались близки к ожидаемым.

Мутациями и генетической конверсией при клональном размножении нельзя объяснить наличие всех гетерозигот по трем аллелям одного локуса и всех комбинаций гетерозигот по двум полиморфным локусам, наблюдаемое у A. vaga.

При клональном размножении, а также при негомологичной рекомбинации неравновесие по сцеплению двух локусов не зависит очевидным образом от физического расстояния между ними. В данном случае, неравновесие по сцеплению было тем выше, чем меньше было физическое расстояние между двумя локусами (Рис. 2).



Рис. 2. Зависимость неравновесия по сцеплению от расстояния между локусами. С изменениями из Vakhrusheva et al. 2020

При клональном размножении, филогенетические реконструкции, построенные по двум различным гаплотипам одной особи, соответствуют друг другу – поскольку гаплотипы наследуются вместе и имеют одну и ту же эволюционную историю. В случае A. vaga, гаплотипы одной особи часто располагались на разных ветвях филогенетического дерева (Рис. 3).



Рис. 3. – Филогенетические реконструкции по четырем участкам генома длиной 604 – 1348 пар нуклеотидов показывают большее сходство одного из гаплотипов особи с гаплотипом другой особи, а не вторым гаплотипом той же особи. Vakhrusheva et al. 2020

Кроме того, филогенетические реконструкции показали, что три из одиннадцати особей (L1-L3) имеют гибридное происхождение, причем гибридизация происходила неоднократно (приведенные выше результаты относятся к восьми оставшимся генотипам L4-L11).

Таким образом, получены убедительные доказательства существования какой-то формы генетического обмена, неотличимой по результатам от полового размножения. Бделлоидеи не опровергают теоретические представления о преимуществах полового размножения per se, однако сохраняют интригу – по-прежнему непонятно, как они, собственно, занимаются сексом и есть ли на свете самцы бделлоидных коловраток.


НАЗАД К СПИСКУ...