Комментарий к статье:
Rozenberg JM, Boguslavsky D, Chistopolsky I, Zakharov I and Dyakonova V. Rest Induces a Distinct Transcriptional Program in the Nervous System of the Exercised L. stagnalis.International Journal of Molecular Sciences (IJMS) 26(14):6970; 10.3390/ijms26146970
![]() © Дьяконова Варвара Евгеньевна,, г.н.с. доктор биологических наук, профессор РАН.
Область научных интересов: нейроэтология, нейробиология, нейротрансмиттеры, поведение. Изменения окружающей среды могут вынуждать животных мигрировать, предполагая более интенсивную локомоцию или физическую нагрузку, чем в обычных условиях. Известно, что физические нагрузки активируют функции мозга. Бег улучшает память, усиливает нейрогенез, облегчает принятие решений, снижает тревожность и депрессию, уменьшая неблагоприятное влияние стресса. Эти изменения могут играть важную роль в адаптации нервной системы к изменяющейся окружающей среде и условиям жизни. У позвоночных эти эффекты двигательной активности опосредованы несколькими нейромодуляторными и нейротрофическими системами мозга [Heijnen et al., 2015]. Относительно недавно у грызунов были выявлены изменения в экспрессии генов и состоянии открытого хроматина во фронтальной коре и гиппокампе под влиянием двигательной активности, которые сохранялись даже у потомков двух последующих поколений тренированных животных [Yang et al., 2021; Mezheritskiy, Dyakonova 2022]. Исследования на различных первичноротых (беспозвоночных) животных свидетельствуют о том, что эти эффекты видоспецифичной интенсивной локомоции могли сформироваться уже на ранних этапах эволюции животных [Dyakonova et al., 2022]. Например, у нематоды C. elegans двигательная активность (плавание) способствует обучению и запоминанию, а также оказывает защитное действие от нейродегенеративных заболеваний. У насекомых интенсивная локомоция повышает выносливость, улучшает сон и пищевое поведение, ориентацию, повышает агрессивность и устойчивость к некоторым раздражителям. Многие из этих эффектов ранее были описаны у млекопитающих как благоприятные последствия бега, что указывает на определенное сходство между отдаленно родственными видами. Результаты, полученные на первичноротых организмах, открыли новые перспективы для выяснения молекулярных механизмов, лежащих в основе влияния физических упражнений на функции мозга и адаптацию к новым условиям. Ведь, многие беспозвоночные являются превосходными экспериментальными моделями. У пресноводной улитки Lymnaea stagnalis интенсивное мышечное ползание в условиях низкой воды сопровождается формированием памяти, что облегчает последующее поведение в новой, совершенно сухой среде [Dyakonova et al., 2019]. Улитки после однократной физической нагрузки быстрее принимают решения и демонстрируют более высокую скорость передвижения в новой среде [Korshunova et al., 2016]. Эти поведенческие изменения коррелировали с возбуждением серотониновых нейронов после физической нагрузки, за которым следовало дофамин-зависимое снижение активности серотониновой системы у отдохнувших после физической нагрузки животных [Dyakonova et al., 2019]. Сравнение поведения, нейрональной активности и метаболизма серотонина у тренированных, контрольных и отдохнувших животных позволило предположить, что отдых после физической нагрузки — это особое состояние нервной системы [Aonuma et al., 2020]. Оно отличалось от состояния контрольных, нетренированных животных и имело ещё более выраженные отличия от животных, взятыми сразу после физической нагрузки. Транскрипционные изменения, происходящие при физической нагрузке и отдыхе, а также сопутствующие формированию памяти о физической нагрузке в нервной системе, были неизвестны. Мы предположили, что интенсивная локомоция и отдых вызывают разные изменения транскрипции в ЦНС и провели профилирование и аннотацию экспрессии генов центральных ганглиев улитки при трех поведенческих состояниях: (1) в контроле (обычные аквариумные условия плюс хандлинг); (2) интенсивная локомоция на мелководье в течение двух часов; (3) два часа отдыха в глубокой воде после периода двухчасовой нагрузки. Нам хотелось ответить на три вопроса. Какие гены и функциональные генные сети реагируют на физическую нагрузку и отдых в центральной нервной системе? Насколько различаются изменения, вызванные физической нагрузкой и отдыхом на уровне экспрессии генов? Существуют ли у улиток и млекопитающих общие (консервативные?) гены, реагирующие на физическую нагрузку? Мы обнаружили, что физическая активность и отдых после нее, действительно, вызывают изменения в экспрессии разных генов. Это хорошо видно на первом рисунке, иллюстрирующем изменения в количественном распределении транскриптов (по оси Х : 2 часа локомоции по сравнению с контролем, а по оси У: 2 часа отдыха после локомоции по сравнению с контролем). Видно, что оба состояния отличны от контроля, но большинство генов изменило свою экспрессию либо при нагрузке, либо при отдыхе (точки «прижимаются» к осям). Та же закономерность видна и на соседнем рисунке, который представляет количественное распределение в соответствии со знаком изменений экспрессии: повышения или понижения. Рис. 1. Гены, дифференциально экспрессирующиеся у L. stagnalis в ответ на физическую нагрузку и отдых, представляют собой разные множества. Диаграмма рассеяния двоичного логарифма кратности изменений уровней экспрессии изоформ после отдыха и после упражнений относительно контрольных значений. Число транскриптов, кодирующих белки, в группах, которые сходно или разнонаправлено регулируются в состоянии покоя и при физической нагрузке с цветовым кодом для каждой группы. Функциональная аннотация генов показала, что два часа интенсивной локомоции индуцируют в основном гены, модифицирующие хроматин, везикулярный транспорт и клеточный цикл, в то время как гены, связанные с нейроразвитием, поведением, синаптической активностью и гормональным ответом, напротив, преимущественно репрессируются. Эти изменения полностью нормализовались через два часа последующего отдыха. В свою очередь, отдых индуцировал экспрессию генов, функционирующих в нейрональной дифференцировке и структуре/активности синапсов, в то время как гены, отвечающие за митотические процессы, трансляцию и деградацию белков, репрессировались. Рис. 2 Схематическое изображение основных функциональных изменений в нервной системе улитки под влиянием нагрузки и отдыха, предложенное на основании данных сравнительного анализа транскриптомов ЦНС и предыдущих поведенческих исследований. Интенсивная локомоция регулирует множество транскрипционных коактиваторов и репрессоров у L. stagnalis, в то время как отдых индуцирует другой набор транскрипционных модуляторов, которые, вероятно, опосредуют переключение между двумя различными наборами генов, затрагиваемыми физическими упражнениями и отдыхом. Примечательно, что дефицит этих транскрипционных регуляторов связан с дефектами нейроразвития у мышей и людей, включая TDRD3 [Zhu et al., 2023]; SmarcA4 [Zhang et al., 2016]; Kmt2a/Mll1 [Jakovcevski et al., 2016], TRRAP [Cogné et al., 2019], фактор транскрипции AUTS2 [Biel et al., 2022] и многие другие, что позволяет предположить, что эти ТФ играют важную роль в нейрональных функциях у далеких в эволюционном отношении видов. Рис. 3. Гены из кластеров аннотаций, регуляция которых меняется после физической нагрузки или отдыха. Большинство транскриптов, подавляемых или индуцируемых при физической нагрузке, нормализуются у животных в состоянии покоя. Цвета соответствуют логарифмическим значениям (p-значениям) изменений экспрессии генов у животных в состоянии покоя по сравнению с контрольными. В прошлом году были опубликованы данные транскриптомного анализа изменений содержания мРНК в нейронах гиппокампа у мышей после четырех недель произвольных упражнений (бег в колесе) (Methi et al., 2024). Мы оценили, отличается ли перекрытие множеств генов, регулируемых у улиток и в гиппокампе мышей физической нагрузкой, от случайного. У улиток обнаружено 9806 генов, гомологичных генам мышей, и их можно сопоставить с геном ETEREZID у мышей. В гиппокампе мышей обнаружено 328 индуцируемых и 811 репрессируемых физическими упражнениями генов. Из 314 транскриптов, репрессированных физической нагрузкой у улитки с уникальными мышиными аннотациями, 50 были подавлены и 25 активировались у мышей (26 и 11 ожидалось случайно, p = 4 x 10-10, критерий хи-квадрат Пирсона), тогда как из 252 транскриптов, индуцированных физической нагрузкой, 31 был подавлен, а 9 были индуцированы (21 и 8,5 ожидалось случайно, p = 0,06, критерий хи-квадрат Пирсона) в гиппокампе мышей. Таким образом, перекрытие множеств генов, регулируемых у улиток и в гиппокампе мышей физической нагрузкой отличается от случайного, особенно это проявилось в отношении генов, чья активность была подавлена физической нагрузкой у улитки. В отношении группы генов, изменивших экспрессию после отдыха у улитки, более высокая достоверность неслучайного отличия от множества генов, регулируемых упражнениями в гиппокампе мышей, получена, наоборот, для генов, число транскриптов которых повысилось. Анализ генов, регулируемых физической нагрузкой, с помощью Metascape выявил аннотации гомологичных генов человека, связанных с синаптической сигнализацией, химической синаптической передачей и заболеваниями аутистического спектра. Рис. 4. Аннотация общих генов, регулируемых физической нагрузкой у улиток и мышей. A. Кластеризация аннотаций, представленных в избыточном количестве в списках генов с изменившимся числом транскриптов. B. Кластеризация генов и соответствующих аннотаций. Цвета соответствуют логарифмическому изменению (кратности изменения) у улитки после физической нагрузки. Среди генов, экспрессия которых повышается при физической нагрузке как у улиток, так и у мышей, присутствуют ARRDC2 и Unc80. Белок ARRDC2 локализован в цитоплазматической и везикулярной мембранах и принадлежит к семейству белков аррестина, играющих важную роль в десенсибилизации и интернализации рецепторов, сопряжённых с G-белком (GPCR). У улиток его экспрессия остаётся слегка повышенной и после отдыха. Острая аэробная нагрузка также увеличивала экспрессию Arrdc2 и Arrdc3 в скелетных мышцах [Gordon et al., 2019], и было высказано предположение, что Arrdc2 участвует в атрофии, вызванной бездействием, особенно в стареющих мышцах [Laskin et al., 2024]. Unc80 кодирует белок, который является компонентом потенциал-независимого комплекса ионных каналов «утечки». Каналы утечки играют важную роль в установлении и поддержании мембранного потенциала покоя (МП) в нейронах у беспозвоночных и млекопитающих [Pierce-Shimomura et al., 2008]. По крайней мере, у улиток, изменения МП, действительно, были обнаружены в нейронах после нагрузки и в ЦНС и после их полной изоляции [Dyakonova et al., 2019]. Вероятно, что долгосрочные изменения, вызванные произвольными упражнениями, также связаны с регуляцией МП в некоторых нейронах гиппокампа у мышей. Однако до сих пор проблематично обнаружить изменения уровня МП в нейронах мозга млекопитающих. Примечательно, что Unc 80 широко распространен в нервной системе и у нематоды C. elegans, при этом черви с нокаутированным геном Unc80, способны ползать, но не способны переключаться на более интенсивную и быструю локомоцию, например, на плавание [Pierce-Shimomura et al., 2008]. Следовательно, Unc 80 участвует в нейрональном и нервно-мышечном обеспечении интенсивной локомоции у различных видов, что делает его наряду с Arrdc2 одним из наиболее вероятных кандидатов на роль эволюционно-консервативного генного ответа, индуцированного двигательной активностью. У человека мутации в Unc80 связаны с врожденной инфантильной энцефалопатией, умственной отсталостью и проблемами роста [Parra-Díaz et al., 2025]. Среди транскриптов, экспрессия которых в ЦНС улиток и гиппокампе мышей снижается под действием физической активности, можно назвать Inpp4a; Aak1; Arid1b; Smurf2; Bptf; Dgkb; Mllt10; Cacnb2. Инозитолполифосфат-4-фосфатаза типа I A (Inpp4a) модулирует прогрессирование клеточного цикла и выживаемость клеток. В нейронах она участвует в регуляции транспорта везикул, реорганизации цитоскелета и экспрессии глутаматных рецепторов N-метил-D-аспартатного типа (NMDA-рецепторов) на поверхности клетки, защищая нейроны от эксайтотоксичности и гибели. Aak1 относится к подсемейству серин/треониновых протеинкиназ SNF1 и также участвует в эндоцитозе рецепторов через клатриновую ось и миграции дочерних клеток нейробластов [Knop et al., 2024]. Снижение ее активности способствует уменьшению боли [Kostich et al., 2016], в то время как повышение содержания ее белкового продукта недавно было связано с депрессивным расстройством [Xu et al., 2025]. Эти данные согласуются с наблюдаемым снижением экспрессии AAK1 после физических упражнений и известными обезболивающими и антидепрессивными эффектами физических упражнений. Продукт гена ARID1B также участвует в пролиферации и дифференцировке нейрональных предшественников путем ремоделирования хроматина и восстановления поврежденной ДНК. Вместе со SMARCA4 он входит в комплекс ремоделирования хроматина, специфичный для нейрональных прогениторных клеток (комплекс npBAF), и комплекс ремоделирования хроматина, специфичный для нейрональных прогениторных клеток (комплекс nBAF), который вызывает переключение со стволового/прогениторного на постмитотический механизм ремоделирования хроматина. ARID1B — один из наиболее часто мутирующих генов у лиц с интеллектуальной инвалидностью [van der Sluijs et al., 2024]. Mllt10 и Bptf являются транскрипционными факторами. Bptf (транскрипционный фактор с бромодоменом и PHD-доменом) также участвует в ремоделировании хроматина и является одним из ключевых регуляторов путей нейрогенеза в комплексе NURF, наряду с упомянутым выше SMARCA4, регуляция которого также меняется при физической нагрузке у улиток. Снижение экспрессии Smurf2 может свидетельствовать об активации высококонсервативного сигнального пути, а именно рецептора трансформирующего фактора роста бетта (TGFBR). TGFBR необходим для развития нервной системы и функционирования нервной системы на протяжении всей жизни и нарушается при нейродегенеративных заболеваниях Снижение экспрессии транскриптов Dgkb (диацилглицеролкиназа бета) как у улиток, так и у мышей предполагает повышенную продукцию диацилглицерина/ДАГ и снижение продукции фосфатидной кислоты после физической нагрузки. Dgkb преобразует диацилглицерол/ДАГ в фосфатидную кислоту/фосфатидат/ПА и регулирует соответствующие уровни этих двух биоактивных липидов. Эти данные также указывает на изменения в GPCR и повышенную цитозольную сигнализацию Ca2+. Интересно, что у мышей с нокаутом Dgkb наблюдается ряд психомоторных изменений в поведении, таких как снижение тревожности и депрессии, а также гиперактивность [Kakefuda et al., 2010]. Эти изменения схожи с поведенческими последствиями физических упражнений у мышей и улиток. Поэтому можно предположить, что, по крайней мере частично, эти поведенческие эффекты могут быть опосредованы снижением количества транскриптов Dgkb после физических упражнений. Также было показано, что DGKβ регулирует образование шипиков в дендритах, играя важную роль в когнитивных процессах, включая память [Shirai et al., 2010]. Таким образом, мы идентифицировали гены, участвующие в транскрипционном ответе нервной системы L. stagnalis на интенсивную локомоцию и последующий отдых. Этот транскрипционный ответ предполагает, что отдых после тренировки функционально значим для положительного эффекта упражнений. Отдых активирует гены, связанные с нейрональным развитием, которые могут способствовать обучению, памяти и адаптации к окружающей среде. Мы также наблюдали сходство транскрипционного ответа на тренировку у грызунов и моллюсков на уровне крупных функциональных кластеров и отдельных генов. У человека гомологичные гены играют ключевую роль в нормальном развитии и сложных неврологических функциях, а их мутации связаны с нарушениями поведения, обучения и развития нервной системы.
Новость подготовила Работа поддержана грантом РНФ 25-14-00147 |